En primer lugar hay que asegurarse que se accede de forma correcta a WebMail. La url de acceso es https://nombredominio/webmail/.

La pérdida de mensajes en WebMail es un problema muy poco frecuente, pero posible. Las principales causas podrían ser las siguientes:

1- El buzón de correo ha superado su capacidad de almacenamiento
2- El dominio o el servidor han superado su capacidad de almacenamiento
3- La carpeta de entrada se ha bloqueado por un virus, mensaje con formato corrupto o por un exceso de capacidad. El resultado irreparable es la pérdida de datos.
5- El usuario descargó sus emails desde un gestor de correo POP3. Aunque parece muy simple, este suele ser el principal motivo para que desaparezcan emails, ya que la descarga de los mismos provoca que se vacíe el archivo de la bandeja de entrada.

Por último le recordamos que webmail es un sistema alternativo de correo, que debe utilizarse preferentemente para consultar emails de forma provisional desde cualquier ubicación. No debe utilizarse como sistema principal y en ningún caso como sustituto a la descarga de correos por parte del usuario a su propio ordenador. La descarga de los correos es el único sistema fiable de almacenamiento de contenidos, ya que el almacenaje en webmail por un plazo prolongado de tiempo está sujeto a un elevado riesgo incidencias (corrupción de archivos, exceso de cuota de espacio, incidencia en el servidor, etc.)

Para lograr que un sistema de webmail se almacene con total seguridad en un servidor, la única opción posible es disponer de un servicio de backup periódico que almacene copias de seguridad de las carpetas webmail en un servidor remoto. De esa forma, todos los contenidos webmail siempre están doblemente protegidos y pueden reponerse en caso de incidencias graves.